Кораллы находятся под угрозой не только из-за повышения температуры воды, но и из-за дисбаланса питательных веществ, который вызывает болезнь чёрных полос. Это заболевание образует тёмные полосы, распространяющиеся по колониям и убивающие живые ткани, оставляя голый скелет.

Исследование, охватившее период с 2000 по 2023 год, показало, что 88% вспышек произошли в районах с серьёзным дисбалансом нитратов и фосфатов, и лишь 16% — после теплового стресса. В лаборатории учёные воссоздали такие условия и получили поражения, идентичные природной болезни, причём вредные микробы уже присутствовали в здоровой ткани до появления симптомов.
Ключевым механизмом оказалось разрушение микробных сетей внутри коралла, после чего быстро размножились цианобактерии, образовавшие толстые слои на поверхности. Человеческая деятельность — сельскохозяйственные стоки и сброс сточных вод — напрямую нарушает баланс азота и фосфора на рифах.
Управление качеством воды на местном уровне может стать важнейшим инструментом для снижения заболеваемости кораллов, даже на фоне глобального климатического кризиса. Около 25% морских видов зависят от коралловых рифов, которые занимают менее одного процента океанского дна.