О необычной научной траектории и поиске своей ниши в науке рассказала Вера Субракова, специалист в области биоинформатики лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ.
.jpg)
— Мой путь в науку начался ещё в студенческие годы. Я училась в Новосибирском государственном университете на кафедре молекулярной биологии. Во время учебы я заинтересовалась изучением рака и роли иммунной системы в его патогенезе. Научные руководители активно привлекали меня к исследовательской деятельности и, можно сказать, воспитали интерес к науке.
Опыт работы во Франции
— У Новосибирского государственного университета была программа двойных дипломов с Францией. Я подала заявку, прошла отбор и меня отправили учиться в Агро ПариТех, Парижский технологический институт наук о жизни, продуктах питания и окружающей среде. Обучение проходило полностью на французском языке. Я знала об этом заранее, поэтому успела подготовиться и начала учить его еще с третьего курса бакалавриата. Хотя адаптация проходила нелегко, полученные опыт и знания стали важным этапом моего профессионального роста.
Программа обучения включала стажировку по биоинформатике, и меня тогда очень заинтересовало это направление.
После обучения я осталась во Франции. Работала инженером в Institut de Recherche Saint Louis, занималась молекулярной биологией, в частности, подготовкой библиотек для секвенирования ДНК единичных клеток (single-cell). Я поработала там два года, а всего прожила во Франции три с половиной года.
Почему вы решили вернуться в Россию?
— Я хотела продолжать заниматься single-cell уже у себя на Родине. Поворотной точкой стал день, когда я увидела анонс одного из воркшопов, который проводила лаборатория биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ. Мне стало интересно узнать больше о том, как устроена работа с single-cell в России. Я связалась с руководителем лаборатории Евгением Денисовым и сказала, что хочу работать в его команде.
Решение оставить свою привычную жизнь во Франции было непростым, но желание вернуться в Россию и заниматься наукой дома было сильнее. Большую поддержку в принятии этого решения оказали родители.
Во Франции моя основная деятельность была связана с экспериментальной частью, возвращение в Россию позволило расширить круг компетенций и заняться фундаментальными аспектами, а также применить приобретенные знания в области биоинформатики.
Над чем Вы работаете сейчас?
— Сегодня я участвую в проекте, целью которого является выявление сходства механизмов эмбриогенеза и онкогенеза. Эмбриогенез — это процесс формирования нового организма из оплодотворенной яйцеклетки, а онкогенез представляет собой механизм развития злокачественной опухоли. Несмотря на принципиальные различия данных процессов, объединяющим фактором является клеточная пластичность, т.е. способность клеток переходить из одного состояния (типа) в другой. При эмбриогенезе пластичность является фундаментальной основой появления новых клеток и тканей, тогда как при раке данный феномен способствует формированию опухолевых клеток, устойчивых к лечению и обладающих высоким потенциалом к метастазированию. Исследуя оба процесса, мы стремимся выявить регуляторы клеточной пластичности, воздействие на которые может послужить основой для разработки принципиально новых подходов в лечении онкологических заболеваний. Проект поддержан грантом Томского НИМЦ на междисциплинарные научные исследования и выполняется под руководством д-ра биол. наук Евгения Денисова.
Сейчас мы готовим статью, в которой представлены промежуточные результаты этого исследования: были обнаружены специфические популяции опухолевых клеток, демонстрирующие признаки сходства с клетками эмбрионального происхождения и фактически являющиеся прогениторами разных типов онкологических заболеваний. В дальнейшем нам необходимо установить причины появления данных клеток и их возможные мишени, воздействие на которые может позволить разработать универсальную стратегию предотвращения развития рака. Несмотря на сложность предстоящего пути, сама идея проекта вдохновляет и открывает перед нами новые горизонты.
- В настоящее время в нашей стране есть дефицит специалистов в области биоинформатики, несмотря на наличие разных образовательных программ. Особенно остро стоит проблема с подготовкой кадров в передовых областях вычислительной биологии, таких как искусственный интеллект и мультиомиксные технологии, в т.ч. на уровне единичных клеток, - прокомментировал д-р биол. наук Евгений Денисов. - В 2025 году на базе Томского НИМЦ стартовала первая в РФ магистерская программа, направленная на подготовку высококвалифицированных и востребованных биоинформатиков в области мультиомики единичных клеток. Подготовка данных специалистов ведётся нами и на площадках международных научно-практических школ “Анализ единичных клеток”, проходящих с 2019 г. в Томске, Москве, Астане и Алматы. С прошлого года мы ввели новое мероприятие – хакатон по биоинформатике, который проходит в Томске и Санкт-Петербурге и собирает студентов, аспирантов, научных сотрудников и врачей для решения актуальных вопросов биологии и медицины.