Систему избиркомов края и органов юстиции связывает многолетнее взаимодействие и сотрудничество по вопросам обеспечивания конституционных избирательных прав граждан и участия политических партий в выборах.
30 января 2009 года между Избирательной комиссией Алтайского края и Управлением Министерства юстиции Российской Федерации по Алтайскому краю впервые было подписано Соглашение о взаимодействии, определившее основные направления и формы совместной работы.
Сегодня, 31 июля, председатель Крайизбиркома Ирина Акимова и начальник Управления Минюста Российской Федерации по Алтайскому краю Лариса Жданова подписали новое Соглашение о взаимодействии Управления Министерства юстиции Российской Федерации по Алтайскому краю и Избирательной комиссии Алтайского края.
Документ учитывает многолетнюю сложившуюся правоприменительную практику новаций конституционного (в том числе избирательного) законодательства, особенности организации избирательного процесса в крае, совершенствование работы в сфере правового просвещения и гражданской активности избирателей и избирательных объединений.