Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разработали высокочувствительные тесты для быстрой диагностики коклюша и других инфекций, вызванных бактериями Bordetella. Результаты исследования опубликованы в журналеMethods.
Коклюш и подобные ему инфекции вызывается несколькими видами бактерийBordetella, включаяB. pertussis,B. parapertussis,B. bronchiseptica иB. holmesii. Коклюш легко распространяется, при общении с больным заражаются около 90 % людей, не имеющих специфического иммунитета. В последние годы заболеваемость коклюшем выросла, поэтому необходимы простые и дешевые методы диагностики, позволяющие контролировать распространение инфекции.
Сотрудники ИХБФМ СО РАН разработали тесты на основе изотермической петлевой амплификации (от англ. Loop mediated isothermal amplification, LAMP — техника амплификации ДНК в одной пробирке) и количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволяющие быстро и точно выявлять четыре вида бордетелл, вызывающих инфекции у человека. Чувствительность LAMP несколько ниже, чем у ПЦР-теста, однако время проведения LAMP составляет всего 30 минут, не требует специальных приборов.
«Разработанные тесты были апробированы на клинических образцах, взятых у пациентов с респираторными инфекциями. Оба метода показали высокую чувствительность и специфичность, выявляя наличие в образце только ДНК бордетелл, а не других патогенов. Согласованность результатов между двумя LAMP и ПЦР составила 94,5 %, что подтверждает их надежность для использования в медицинской практике», — рассказывает младший научный сотрудник лаборатории фармакогеномики ИХБФМ СО РАН Максим Александрович Корюков.
Коклюш — острое инфекционное заболевание, которое в основном поражает невакцинированных детей и подростков. Наиболее характерным признаком коклюша является является приступообразный лающий кашель.
Чаще всего для диагностики бордетелл используются тесты на основе иммуноферментного анализа (ИФА) и ПЦР. ИФА относительно дешев, однако чувствительность этого подхода ниже, чем у методов, выявляющих нуклеиновые кислоты. Коммерческие ПЦР-тесты отличаются высокой чувствительностью, но для их проведения необходимы специализированные диагностические лаборатории с дорогостоящим оборудованием и квалифицированным персоналом, что увеличивает стоимость и время анализа (несколько часов).
Исследование поддержано грантом Правительства Новосибирской области для молодых ученых.
Пресс-служба ИХБФМ СО РАН